產(chǎn)品簡介

長鏈非編碼RNA測序（lncRNA Sequencing）是一種使用特定方法降低樣本中rRNA豐度，對富集到的RNA進(jìn)行文庫構(gòu)建，再對測序數(shù)據(jù)進(jìn)行信息分析的研究方法?？梢淮潍@得樣本中幾乎全部的lncRNA信息，對lncRNA的類別、功能進(jìn)行全方位深入分析，從而快速全面準(zhǔn)確地獲得與特定生物學(xué)過程相關(guān)的lncRNA的信息。

研究內(nèi)容

1) 測序質(zhì)量值分布統(tǒng)計(jì)；

2) 測序數(shù)據(jù)產(chǎn)出統(tǒng)計(jì)；

3) 與參考基因組比對分析；

4) RNA-Seq整體質(zhì)量評估：Insert長度檢驗(yàn)；測序隨機(jī)性分析；測序飽和度分析；

5) 轉(zhuǎn)錄本拼接；

6) 已知lncRNA比對分析與統(tǒng)計(jì)；

7) 候選lncRNA基本篩選；

8) class_code的分布；

9) 候選lncRNA編碼潛能篩選（CPC、CNCI分析，pfam蛋白結(jié)構(gòu)域分析，編碼潛能預(yù)測維恩圖）；

10) 最終過濾結(jié)果管道圖；

11) lncRNA靶基因預(yù)測（trans和cis作用）；

12)  lncRNA表達(dá)定量分析；

13) lncRNA差異表達(dá)分析；

14) 樣品間lncRNA相關(guān)性分析（含生物學(xué)重復(fù)樣品）；

15)Cis作用差異lncRNA靶基因注釋富集分析；

16)Cis作用差異lncRNA靶基因PPI分析；

17)Trans作用差異lncRNA靶基因注釋富集分析；

18) Trans作用差異lncRNA靶基因PPI分析；

19)mRNA基因表達(dá)定量；

20)重復(fù)相關(guān)性檢測（有生物學(xué)重復(fù)）；

21) 差異表達(dá)基因篩選（兩個(gè)或以上樣品）；

22) 差異表達(dá)基因聚類分析（兩個(gè)或以上樣品）；

23)差異表達(dá)基因的功能注釋（兩個(gè)或以上樣品）；

24)差異表達(dá)基因的GO和KEGG富集分析（兩個(gè)或以上樣品）；

25)差異表達(dá)基因蛋白互作網(wǎng)絡(luò)；

26)lncRNA與mRNA表達(dá)水平比較；

結(jié)果展示

送樣建議