產(chǎn)品簡(jiǎn)介
完整的轉(zhuǎn)錄本包括了從5’端到3’端polyA尾的序列，長(zhǎng)度集中分布在1-6kb。二代測(cè)序技術(shù)由于讀長(zhǎng)較短，得到的測(cè)序片段需要拼接，得到的轉(zhuǎn)錄本可能會(huì)產(chǎn)生拼接錯(cuò)誤和較多的嵌合體，從而不能得到完整的轉(zhuǎn)錄本。第三代測(cè)序技術(shù)Pacbio利用單分子實(shí)時(shí)測(cè)序技術(shù)（SMRT），由于其超長(zhǎng)的讀長(zhǎng)（平均15kb），無(wú)需拼接即可直接獲取完整的全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄本，因此可得到更高質(zhì)量的轉(zhuǎn)錄本，有利于mRNA結(jié)構(gòu)的研究，如可變剪切、融合基因、等位基因表達(dá)等。
研究?jī)?nèi)容
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有參全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組分析內(nèi)容 |
無(wú)參全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組分析內(nèi)容 |
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1) 數(shù)據(jù)質(zhì)控、轉(zhuǎn)錄本分類(lèi)； 2) 轉(zhuǎn)錄本聚類(lèi)與校正； 3) 與參考基因組比對(duì)； 4) 進(jìn)行可變剪切分析； 5) 新基因預(yù)測(cè)； 6) 融合基因分析； 7) 作為參考序列，定量分析； 8) 編碼蛋白框預(yù)測(cè)； 9) lncRNA預(yù)測(cè)。 |
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1) 數(shù)據(jù)質(zhì)控、轉(zhuǎn)錄本分類(lèi)； 2) 轉(zhuǎn)錄本聚類(lèi)與校正； 3) 七大轉(zhuǎn)錄本數(shù)據(jù)庫(kù)注釋； 4) 作為參考序列、定量分析； 5) lncRNA預(yù)測(cè)； 6) 編碼蛋白框預(yù)測(cè)。
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結(jié)果展示
送樣建議
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