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產(chǎn)品簡(jiǎn)介
環(huán)狀RNA(circular RNA)是5’端和3’端共價(jià)結(jié)構(gòu)閉合環(huán)狀的非編碼RNA,是廣泛存在于動(dòng)植物中的一種特殊的lncRNA,具有很高的保守性和組織特異性,獨(dú)特的環(huán)狀結(jié)構(gòu)使其不易被RNase降解,在胞內(nèi)具有較強(qiáng)的穩(wěn)定性。按其來(lái)源可分為內(nèi)含子CircRNA和外顯子CircRNA兩類,主要通過(guò)(1)作用于轉(zhuǎn)錄組因子,(2)競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合miRNA,(3)結(jié)合核糖體誘導(dǎo)開環(huán)再重新表達(dá)等三種方式實(shí)現(xiàn)其調(diào)控基因表達(dá)的功能。CircRNA一經(jīng)發(fā)現(xiàn)就因其獨(dú)特的存在形式引起科學(xué)家的廣泛興趣,隨著近幾年測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,CircRNA檢測(cè)技術(shù)亦日漸成熟。
研究?jī)?nèi)容
1) 測(cè)序質(zhì)量值分布統(tǒng)計(jì);
2) 測(cè)序堿基質(zhì)量控制;
3) 測(cè)序數(shù)據(jù)產(chǎn)出統(tǒng)計(jì);
4) 測(cè)序文庫(kù)質(zhì)量評(píng)估;
5) 與參考序列進(jìn)行比對(duì)(比對(duì)效率統(tǒng)計(jì);比對(duì)結(jié)果作圖);
6) CIRI識(shí)別環(huán)狀RNA;
7) circRNA的鑒定;
8) circRNA的統(tǒng)計(jì);
9) circRNA來(lái)源基因功能注釋;
10) circRNA表達(dá)定量分析(定量及統(tǒng)計(jì));
11) 聚類分析;
12) 樣品間circRNA相關(guān)性分析(含生物學(xué)重復(fù)樣品);
13) circRNA差異表達(dá)分析;
14) 差異表達(dá)circRNA數(shù)目統(tǒng)計(jì)及聚類分析;
15) 差異表達(dá)circRNA來(lái)源基因的功能注釋(NR,GO,KEGG等)及富集分析;
16) 差異表達(dá)circRNA來(lái)源基因蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析。
結(jié)果展示
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